南京腦科醫(yī)院，又名南京醫(yī)科大學(xué)附屬腦科醫(yī)院，江蘇省精神衛(wèi)生中心，始建于1947年，是我國(guó)最早的國(guó)立腦醫(yī)學(xué)專(zhuān)科醫(yī)院。南京市胸科醫(yī)院始建于1950年，具有胸部疾病診療專(zhuān)科特色。2018年6月26日，南京市整合南京腦科醫(yī)院與南京市胸科醫(yī)院資源，成為新的南京腦科醫(yī)院，一院兩區(qū)。

目前醫(yī)院擁有員工近2200人，床位近2000張，有精神科、神經(jīng)內(nèi)科、神經(jīng)外科、呼吸科、胸外科、心血管內(nèi)科、兒童心理衛(wèi)生研究中心、醫(yī)學(xué)心理科、老年醫(yī)學(xué)科、康復(fù)醫(yī)學(xué)科等42個(gè)臨床科室，承擔(dān)著南京市、江蘇省乃至全國(guó)神經(jīng)、精神、胸部疾病的醫(yī)療、康復(fù)、預(yù)防、教學(xué)、科研和司法鑒定等任務(wù)，同時(shí)承擔(dān)著相關(guān)政府指令性工作及突發(fā)應(yīng)急事件的心理救援等處置任務(wù)，在國(guó)家重大城市任務(wù)和突發(fā)公共衛(wèi)生事件處置中發(fā)揮社會(huì)維穩(wěn)作用。

醫(yī)院現(xiàn)為國(guó)家精神區(qū)域醫(yī)療中心創(chuàng)建單位，世界衛(wèi)生組織（WHO）兒童心理衛(wèi)生科研培訓(xùn)合作中心（亞太地區(qū)唯一的在中國(guó)設(shè)立的科研與培訓(xùn)合作中心），南京醫(yī)科大學(xué)、南京大學(xué)、東南大學(xué)博士學(xué)位培養(yǎng)點(diǎn)，博士后科研工作站。醫(yī)院整體實(shí)力位于全國(guó)前列，其中精神科為首批國(guó)家臨床重點(diǎn)專(zhuān)科，在2021年度復(fù)旦中國(guó)醫(yī)院排行榜中，精神醫(yī)學(xué)位列專(zhuān)科綜合排行榜第7名、專(zhuān)科聲譽(yù)排行榜第6名。